Eugène Bataillon (Annoire, 1864- Castelnau-le-Lez, 1953) fue un biólogo francés, profesor en la Universidad de Borgoña.

Fue el padre del hispanista francés Marcel Bataillon.

Eugène Bataillon trabajó especialmente sobre el problema de la partenogénesis experimental.

En la línea de las experiencias de Jacques Loeb (1859-1924) y de Nikolai Mikhailovich Kulagin (1860-1940), Eugène Bataillon llevó a cabo una serie de experiencias zoológicas, de modo que logró provocar una reacción en huevos no fecundados de rana logrando su desarrollo.

En este sentido se le considera el creador de la partenogénesis traumática.