Esta estación tiene muchas peculiaridades, pues en ella trabajan 5 operadoras ferroviarias diferentes: SBB-CFF-FFS, BLS (Berna - Lötschberg - Simplon), DB, BOB (Berner Oberland Bahn) y ZentralBahn.
Los SBB-CFF-FFS operan únicamente una línea InterCity (IC): La compañía BLS (Berna - Lötschberg - Simplon) opera trenes regionales (RegioExpress y Regio) hacia Spiez y Zweisimmen:[2] La operadora alemana DB presta servicio en la estación mediante sus trenes ICE que comunican a Interlaken con varias ciudades alemana, entre ellas la capital, Berlín, además de poder realizar trayectos hasta Basilea-SBB o Berna.
[3] Ofrece salidas cada hora hacia las comunas de Lauterbrunnen y Grindelwald.
Como característica de estos trenes regionales, son operados con 2 semitrenes, que en el tramo Interlaken Ost - Zweilütschinen van unidos, separándose los semitrenes en esa estación y circulando uno hacia Lauterbrunnen y otro hacia Grindelwald.
En sentido contrario, cada semitren procede de su destino, uniéndose los dos en Zweilütschinen y circulan juntos hasta Interlaken.