Fue inaugurada en 1965 sustituyendo a la histórica estación de la ciudad abierta en 1877.

La estación se encuentra en el punto kilométrico 71,1 de la línea Barcelona-Cerbère en su sección Massanet-Massanas a Port Bou y Cerbère a 29,7 metros de altitud.

Dicha fusión se mantuvo hasta que en 1941 la nacionalización del ferrocarril en España supuso la desaparición de todas las compañías privadas existentes y la creación de RENFE.

Los cambios de andén se realizan gracias a pasos subterráneos.

Dichas conexiones que se realizaban desde Barcelona, Madrid, el Levante y la Comunidad Murciana existían tanto con trenes Talgo como los nocturnos Trenhotel y Estrella.