Antes de la dinastía Song, la escuela Linji era bastante oscura y se sabe muy poco sobre su historia temprana.
[cita requerida] La escuela Fayan fue especialmente influyente en el Tang del Sur (937-975) y Wuyue (907-978).
La escuela Fayan fue la primera facción en obtener reconocimiento en la corte Song, debido a la influencia del erudito-oficial budista Zanning (919-1001).
El Guangdeng lu contiene breves detalles biográficos sobre la vida y las acciones de Linji.
Aproximadamente en la misma época se compiló el Deshan Sijia lu, un texto comparable que contiene los registros de Deshan Xuanjian (780-865), cuyo linaje se remonta a Shitou Xiqian, e incluye la rama Chan de Xuefeng Yicun, Yumen y Fayan.
Los datos biográficos sobre la vida de Linji se amplían y aparecen al final del texto.
Durante esta época, la corte Song se retiró al sur del Yangtze y estableció su capital en Lin'an (actual Hangzhou).
Las dos escuelas competían por el apoyo de los literatos, que se hicieron más poderosos cuando el gobierno Song empezó a limitar su influencia en la sociedad.
[7] Organizó el estudio de los koans en un sistema,[9] que se exportó a Japón en este periodo.
El chan se enseñaba junto al budismo de la Tierra Pura en muchos monasterios budistas chinos.
Con el tiempo se perdió gran parte de la distinción entre ellos, y muchos maestros enseñaban tanto el Chan como la Tierra Pura.
[11] Con la caída de los Ming, varios maestros chan chinos huyeron a Japón, fundando la escuela Ōbaku.
Muchos maestros chan actuales remontan su linaje a Xuyun, entre ellos Sheng-yen (聖嚴, Shèngyán) y Hsuan Hua (宣化, Xuānhuà), que han propagado el chan en Occidente, donde ha crecido constantemente a lo largo del siglo XX y XXI.
La secta zen japonesa conocida como escuela Rinzai es una rama del linaje que fundó Linji.
[web 1] La ya desaparecida Fuke-shū también tenía estrechos vínculos con la escuela Rinzai y reivindicaba su afiliación al linaje Linji.