El iranólogo Desmond Durkin-Meisterernst señala que la escritura maniquea sirvió principalmente para escribir numerosas lenguas iranias medias (persa medio maniqueo, parto, sogdiano, persa nuevo temprano, bactriano) y uigur antiguo (una lengua túrquica).

Además, la ortografía maniquea era menos conservadora o histórica y se correspondía más con la pronunciación contemporánea: por ejemplo, una palabra como āzād "noble, libre" se escribía ʼčʼt en pelvi, pero ʼʼzʼd en persa medio maniqueo del mismo período.

Asimismo, fuera del maniqueísmo, el dialecto de Parsa (o Persia en sentido estricto) también se registró en otros sistemas, incluidas las escrituras pelvi (en cuyo caso se conoce como lengua "pelvi" o persa medio zoroástrico) y el alfabeto avéstico (en cuyo caso se conoce como pazend).

Se convirtió en una religión oficial del estado entre los uigures durante cinco siglos (del siglo VIII al XII) y, por tanto, muchos manuscritos supervivientes se encuentran en la región de Turfán usando los idiomas iranios antes mencionados, uigur antiguo y lenguas tocarias.

En el siglo xix, expediciones alemanas descubrieron varios manuscritos maniqueos en Bulayïq, en la Ruta de la Seda en lo que hoy es Xinjiang.