Fue relevado del mando a partir de entonces.

Más tarde, fue responsabilizado por la pérdida de Crimea, arrestado en Rumania y juzgado por una corte marcial.

Heinz Guderian fue seleccionado como investigador especial del caso.

Guderian procedió despacio y finalmente Jaenecke fue silenciosamente absuelto en junio de 1944.

La sentencia fue conmutada por 25 años de trabajos forzosos.