Dos de sus asistentes en Berlín fueron Curt Schimmelbusch (1860–1895) y Friedrich Gustav von Bramann (1854–1913).

[2]​ Su hijo, Gustav von Bergmann (1878-1955) fue un destacado médico de medicina interna.

[2]​ Bergmann escribió numerosos trabajos médicos y quirúrgicos, incluido un tratado clásico sobre lesiones en la cabeza, Die Lehre von den Kopfverletzungen (1880), y un libro sobre cirugía cerebral, Die Chirurgische Behandlung der Hirnkrankheiten (1888).

[2]​ En 1904, con Martin Kirchner y Robert Kutner, cofundó la Zeitschrift für ärztliche Fortbildung ("Revista de Educación Médica").

[6]​ El Ernst-von-Bergmann-Kaserne en Múnich, y la Placa Ernst von Bergmann de la Asociación Médica Alemana, fueron nombrados así en su honor.