Desde el año 1986, el Equipo ha trabajado en 50 países de Latinoamérica, África, Europa y Asia; en lugares como Bosnia, Angola, Timor Oriental, Polinesia francesa, Croacia, Kurdistán iraquí, Kosovo y Sudáfrica.

Inmediatamente después de recuperada la democracia en Argentina y de que entrara en funcionamiento la CONADEP, comenzaron a realizarse exhumaciones porque se sospechaba que muchas tumbas NN podían estar ocultando desaparecidos.

Eric Stover,[15]​ director del Programa del Ciencia y Derechos Humanos de la mencionada asociación, organizó un viaje junto con una delegación a Argentina, entre ellos se encontraba el Dr. Clyde Snow, experto en Antropología forense, quien convocó a antropólogos, arqueólogos y médicos para la exhumación e identificación de los esqueletos.

Hoy, la ONG colabora en el entrenamiento de nuevos equipos en otros países donde las investigaciones sobre violaciones a los derechos humanos sean necesarias.

Trabaja con organizaciones humanitarias, sistemas judiciales e institutos forenses en distintos país del mundo a los que se les dictan diferentes seminarios para su formación.

En sus oficinas argentinas, en cajas de archivo, todavía hay setecientas osamentas que esperan recuperar su identidad.

Sus restos fueron trasladados hacia Cuba, donde descansan en Santa Clara conmemorando su heroica gesta en la Revolución.

[29]​ En el año 2006 el EAAF identificó en el Cementerio de Avellaneda a cinco cuerpos exhumados pertenecientes a Miguel Ángel Mastrogiovanni, Ismael Monzón, Ana María Liendo, Juan Benítez y Alberto Eduardo Delfino.

Al mismo tiempo, en nuestro laboratorio de Córdoba, se compararon las muestras aportadas por las 107 familias junto con las muestras que tomamos de los cuerpos, y pudimos identificar a 90 soldados”.

Para identificar un cuerpo se comparan información, y si hay una suficiente cantidad de coincidencias se puede identificar a esa persona, que deja de ser una persona sin nombre para devolverle su identidad”, afirma Fondebrider....".

[34]​ La institución tiene 65 miembros repartidos en Buenos Aires, Tucumán, Nueva York, México y Sudáfrica.

[26]​[35]​ Algunos de los científicos miembros del EAAF son: Luis Fondebrider, Silvina Turner, Mercedes Doretti, Patricia Bernardi, Rafael Mazzella, Daniel Bustamante, Carlos Somigliana,, Cecilia Ayerdi, Andrea del Río.

Fueron parte del EAAF Clyde Snow, Darío Olmo, Anahí Ginarte, Sofía Egaña, Miguel Nieva, Douglas L.