Su principal órgano de dirección es un patronato con personas vinculadas al trabajo educativo y social y a la Compañía de Jesús.

Dichas acciones educativas se complementan con la promoción de iniciativas comunitarias para avanzar hacia la ciudadanía, la inclusión plena en la vida social y la participación democrática.

El principal socio en América Latina es Fe y Alegría que nació en Venezuela en 1955 como propuesta educativa popular de calidad y hoy está presente en 14 países con 1,2 millones de alumnos.

Actualmente, la campaña educativa que Entreculturas ha puesto en marcha recibe el nombre de "¿Igual-da?

", y sus principales objetivos son: Para llevar a cabo todas estas acciones cuenta con personal contratado, pero sobre todo con el trabajo del voluntariado integrado en las 27 delegaciones repartidas en el territorio español.