[1]​ Su primera participación en cine fue en la película Alambrado, pero debido a su carrera como piloto aeronáutico, no pudo seguir en otras producciones.

En 1999, tras su renuncia de LAPA, creó Aquafilms,[2]​ una productora radicada en Buenos Aires, a partir de su actuación en la película Garage Olimpo, dirigido por Marco Bechis, del cual fue además coproductor junto con Amedeo Pagani y Eric Heuman.

Además declaró como testigo y presentó una detallada pericia en el juicio a los pilotos mencionados en las planillas.

Luego trabajó como productor y actor del film Esperando al Mesías (dirigida por Daniel Burman), cubriendo además Enrique uno de los roles protagónicos.

Jorge Gaggero) en coproducción con España, film que obtuvo el Premio Especial del Jurado en el Festival de Sundance; El Otro (dir.

En 2008, estrenó La mujer sin cabeza (dirigida por Lucrecia Martel) presentada en Competencia Oficial en el Festival de Cannes.

Su siguiente obra como director, fue el documental Fuerza aérea sociedad anónima.

Con el apoyo de Adolfo Pérez Esquivel y Nora Cortiñas, Enrique se presentó ante la Corte Suprema mediante la figura de Amicus Curiae (Amigo del Tribunal).

[1]​ Luego de dirigir el corto sobre el asesinato del militante trotskista Mariano Ferreyra (2012), y de participar en la película sobre el mismo caso ¿Quién mató a Mariano Ferreyra?, junto con el periodista Martín Caparrós, Piñeyro se dedicó a su labor como cocinero en su propio restaurante y activista por los derechos humanos.

[8]​ Además, escribió, dirigió y protagonizó su obra teatral de stand up llamada Volar es humano, aterrizar es divino.

[8]​ Enrique Piñeyro, según cuenta, decidió dedicar gran parte de su tiempo a “intentar ayudar”.