En este club formó parte del llamado «equipo de los once aldeanos».
[1] Tenía un hermano menor que también jugó en el club bilbaíno, Antón, conocido como Arieta II.
Eneko Arieta comenzó a jugar al fútbol en varios equipos de su pueblo, en Durango.
Durante sus dos primeras temporadas con el Athletic sus apariciones en el once rojiblanco fueron testimoniales, debido en gran parte a que coincidió con los últimos años de la «segunda delantera histórica», la cual estaba formada por cinco jugadores consolidados como Iriondo, Venancio, Zarra, Panizo y Gaínza.
La siguiente temporada fue crucial para Arieta, ya que con la llegada del nuevo entrenador Ferdinand Daučik, la plantilla sufrió una reestructuración y la "segunda delantera histórica" finalmente se disolvió.