Más concretamente, en el alelo opuesto al gen que las codifica.
Una vez la enzima es sintetizada ejerce su acción rompiendo el cromosoma en el alelo HEG-, a lo cual responde el sistema de reparación del DNA celular por medio de recombinación, utilizando como patrón el DNA intacto del alelo opuesto HEG+ para reparar el daño.
Este DNA que es utilizado como patrón contiene el gen de la endonucleasa.
De esta manera, el gen es copiado en el alelo que inicialmente no lo tenía.
[12] Actualmente, se reconocen 4 diferentes familias estructurales, atendiendo a sus motivos conservados:[3]