[1]​ Su padre fue Emilio Botín y López, el primer presidente ordinario del Banco Santander.

En 1942, el Grupo absorbió los Bancos de Ávila, Torrelavega y Herrero Riva y, en 1946, el Banco Mercantil.

Además, sentó las bases en Hispanoamérica con el objetivo de constituir a futuro el mayor grupo bancario español en el nuevo continente.

[5]​[6]​ Presidió igualmente la Fundación Marcelino Botín, institución de carácter benéfico, asistencial y cultural, con sede en Santander.

[7]​ Estuvo casado con Ana García de los Ríos y Caller.