Después de la independencia en 1962 ocupó el cargo de Embajador en los Estados Unidos, Canadá y México, y Representante permanente en las Naciones Unidas, siendo nombrado en 1963 caballero o Sir (knight bachelor).
Cuando Trinidad and Tobago se convirtió en república en 1976, Clarke fue elegido como el primer Presidente de Trinidad y Tobago, que comprendía a los miembros electos de ambas Cámaras del Parlamento.
Fue reelegido por el Movimiento Nacional del Pueblo, que controló el Colegio Electoral y completó su segundo mandato en 1987.
Desacuerdos con el nuevo gobierno de la Alianza Nacional para la Reconstrucción dio como resultado que Clarke no fuera elegido para una tercera legislatura, siendo sucedido por Noor Hassanali.
Se casó con Lady Ermyntrude Clarke (1921–2002) y estuvo unido con ella casi 50 años.