Recordado por haber impulsado la remontada del 3-1 ante Panamá en las eliminatorias a la Copa del Mundo Sudáfrica 2010, anotando 2 goles en dicho partido "Cheyo" Quintanilla (como es conocido por la afición salvadoreña) fue el jugador emblema de la selección Sub-17 que intentó clasificar al mundial Juvenil de 1997, siendo eliminados en la repesca por Estados Unidos.
En 1999 fue contratado por Club Deportivo FAS quien lo hizo debutar en primera división; posteriormente, en 2001, firmó por el C.D.
Águila, para después ser fichado por el DC United de la Major League Soccer para la temporada 2002.
[3] Retornó nuevamente a El Salvador con el AD Isidro Metapán en el Torneo Apertura 2012 y logró el primer título de campeón en su país.
[5] Luego de cumplir con su suspensión Eliseo Quintanilla consiguió un puesto en C. D. Águila el cual quedó en el aire cuando "Cheyo" abandono el equipo por decisión propia.