La primera vuelta, celebrada el 30 de junio, dejó al presidente incumbente, Miguel Trovoada, del partido Acción Democrática Independiente, obteniendo mayoría simple del 41% de los votos, contra el expresidente Manuel Pinto da Costa, que obtuvo el 37%.
[1] Con una participación del 78%, Trovoada fue reelegido para un segundo mandato con el 52.7% de los votos.
[2] Aunque la elección fue considerada libre y justa por observadores locales e internacionales, Manuel Pinto da Costa, que había reconocido inicialmente los resultados, presentó posteriormente una denuncia por fraude electoral, alegando que habían ocurrido irregularidades en el proceso de registro.
A principios de agosto, el Tribunal Supremo declaró que no podía pronunciarse sobre el recurso presentado por da Costa, y recomendó que el gobierno buscara arbitraje de derecho internacional.
Sin embargo, el 20 de agosto da Costa retiró su denuncia y Trovoada fue confirmado como presidente.