En enero de 1942, la 48.ª División fue separada y reasignada al 16.º Ejército Japonés para la invasión de las Indias Orientales Neerlandesas,[1]​ y fue reemplazada por la 4.ª División.

Mientras el ejército seguía luchando en Filipinas, su oficial al mando, el teniente general Masaharu Homma, solicitó más refuerzos.

[3]​ En agosto de 1942, Homma fue reemplazado por el teniente general Shizuichi Tanaka.

[4]​ En julio de 1942, la 4.ª División quedó bajo el control del 14.º Ejército, al igual que la 30.ª División, que fue asignada a la defensa de Mindanao.

En marzo de 1944, el 14.º Ejército volvió oficialmente al control del Grupo de Ejércitos Expedicionario del Sur.