[5] Debido al éxito de la propuesta, su padre fue elegido gobernador y Eduardo Siqueira Campos fue elegido diputado federal por el nuevo estado vía PDC en 1988, siendo reelegido en 1990.
Durante su mandato, estuvo afiliado en PPR y PPB antes de acompañar a su padre en el PFL.
En 1998 su padre dimitió como gobernador para presentarse a la reelección, una acción que pudo realizar mientras estuviera en el cargo.
Tras dejar el Senado Federal, asumió la presidencia de las filiales de la Rede Record en Tocantins (TV Jovem Palmas, TV Jovem Araguaína y TV Jovem Gurupi), alejándose durante algún tiempo de las actividades partidistas y político-electorales.
[10] En febrero de 2017 se inició la 3.ª fase del Operativo Ápia, tras el descubrimiento de un nuevo núcleo criminal, que, según investigaciones del Ministerio Público Federal y la Policía Federal, estaba vinculado al diputado Siqueira Campos.