Gozó de gran éxito en la época gracias a sus obras ilustrando el Berlín de entonces y sus palacios, en Charlottenburg, Potsdam y el estilo Biedermeier.
Aquí, Gaertner también se representó a sí mismo, su esposa y sus dos hijos, así como algunos contemporáneos destacados: Schinkel, Christian Peter Wilhelm Beuth, Alexander von Humboldt y Federico Guillermo III de Prusia.
Se lo considera el Bernardo Bellotto (Canaletto) de Berlín, sus pinturas del bulevar Unter den Linden y vistas de la ciudad retratan el Berlín del siglo XIX.
Eduard Gaertner trabajó con la precisión de un arquitecto y utilizó la camera obscura en varias oportunidades.
En el 2001 tuvo lugar una gran muestra retrospectiva en Museo del Ephraim Palais de Berlín.