Su hermano mayor, Hans Buchner, también un científico notable, asumió la responsabilidad de su educación tras la muerte temprana del padre en 1872, cuando Eduard tenía solo doce años.

Mientras realizaba estudios en ciencias básicas y bajo la tutoría y supervisión de su hermano mayor, hizo en 1885 su primera publicación relevante en la temática de su interés: Der Einfluss des Sauerstoffs auf Gärungen (La influencia del oxígeno en fermentaciones).

Ahora con más recursos, relaciones y medios a su disposición, continuó con la investigación de la levadura.

Más tarde, en 1903, publicó un libro con un informe más amplio sobre los descubrimientos acerca de la fermentación en la obra Die Zymasegährung (La fermentación de la cimasa), obra escrita en colaboración con Martin Hahn y con su hermano Hans Buchner.

Este último dedicó más tarde su atención hacia otras temáticas y acabó siendo un notable bacteriólogo.