Su capital distrital es Sapalache, que se encuentra a una altitud de 2 449 m s. n. m. A la fecha está conformado por 48 centros poblados o caseríos, que se integran en tres zonas geográficas diferenciadas bajo criterios de integración ecológicos y socioeconómicos: 1) Sierra intermedia: Concentra a 15 caseríos, cuya altitud está entre los 2200 y 2650 m s. n. m., más cercanos a la capital provincial (a la vez son los más alejados de la línea de frontera); esta zona posee riego permanente con producción agrícola y ganadera.

La zona que limita con el Ecuador, está conformada por los caseríos de Peña Rica, Rosarios (Alto y Bajo), Sagrado Corazón de Jesús, Pan de Azúcar, Huaquillas, Palo Blanco, Salinas, Peña Blanca, El Hormiguero, el Chaupe, entre otros.

El territorio de El Carmen de la Frontera se ubica en el valle interandino y posee un relieve variado, predominando las montañas y quebradas.

Se caracteriza por presentar un relieve accidentado, con abundantes afloramientos del sustrato rocoso conformando laderas de gran magnitud de suave y pronunciadas pendientes.

Los suelos utilizados para la agricultura son arcillosos, que van de pobres a medianamente fértiles.