El GeO2 hexagonal tiene la misma estructura que el cuarzo-β, donde el germanio tiene número de coordinación 4.

El dióxido de germanio se puede preparar en ambas formas: cristalina y amorfa.

El GeO2 es sólo ligeramente soluble en ácido pero se disuelve más fácilmente en base para dar germanatos.

[5]​ En contacto con ácido clorhídrico, libera el volátil y corrosivo tetracloruro de germanio.

Ver el artículo fibra óptica para obtener detalles sobre el proceso de fabricación.

Se prefire el GeO2 sobre otros vidrios transparentes al IR porque es mecánicamente fuerte y por tanto preferido por la exigencia del uso militar.

[11]​ El dióxido de germanio tiene una toxicidad baja, pero en dosis más altas es nefrotóxico.