La diócesis tiene al obispo Francisco Carlos da Silva como su ordinario desde el 30 de septiembre de 2015.

La diócesis tiene 8261 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en 23 municipios del estado de São Paulo: Lins, Alto Alegre, Avanhandava, Balbinos, Barbosa, Braúna, Cafelândia, Clementina, Getulina, Glicério, Guaiçara, Guaimbê, Guarantã, Júlio Mesquita, Luiziânia, Penápolis, Pirajuí, Pongaí, Presidente Alves, Promissão, Reginópolis, Sabino y Uru.

La diócesis de Cafelândia (dioecesis Cafaelanden(sis)) fue erigida el 21 de junio de 1926 con la bula Ea est in praesenti del papa Pío XI, obteniendo el territorio de la diócesis de Botucatu (hoy arquidiócesis).

[1]​ Catedral primitiva de la diócesis fue la iglesia matriz de Nuestra Señora del Carmen, hasta 1933, cuando se inauguró la nueva catedral, dedicada a santa Isabel de Hungría.

El 27 de mayo de 1950, mediante la bula Apostolicis sub plumbo del papa Pío XII, la sede episcopal fue trasladada de Cafelândia a Lins y la diócesis tomó su nombre actual.