La diócesis de Juneau fue un territorio eclesiástico o diócesis de la Iglesia católica en el noroeste de Estados Unidos, que comprendía la parte sureste del estado de Alaska.
El 7 de junio de 2019 fue fusionada con la arquidiócesis de Anchorage, que pasó a denominarse arquidiócesis de Anchorage-Juneau.
Fue dirigida por un prelado obispo, que servía como pastor de la iglesia matriz, la Catedral de la Natividad en Juneau en la ciudad de Juneau.
La sede de Juneau fue canónicamente erigida el 23 de junio de 1951, y ha tenido cuatro obispos.
Tomó su territorio del antiguo vicariato apostólico de Alaska.