Junto con el desierto de Nubia, que queda más al norte, constituye la parte oriental del desierto del Sáhara.

Está limitado en el oeste por el uadi Muqaddam y en el norte, este y sur por el gran meandro del Nilo que se forma entre las 4ª y 6ª cataratas.

El Uadi Abu Dom que se dirige del sur al norte, divide el desierto de Bayuda en la parte oriental del Campo volcánico de Bayuda y la parte occidental de las dunas de arena.

El rei Nastasen narra en una estela como se desplazaba por esta ruta entre estas ciudades en ocasión de su coronación.

[1]​ Existe el oasis homónimo de Bayuda, en el centro, a unos 50 km del Nilo (al noroeste).