Deportivo Alavés "C"

[2]​ Tres años después el equipo gana la Preferente y logra el ascenso a la Tercera División de España.En verano de 2003 el Deportivo Alavés llegó a un acuerdo con un modesto equipo vitoriano, el San Ignacio, que había militado la temporada anterior (2002-03) también en Tercera división compitiendo con el Alavés C, pero que había perdido la categoría al finalizar la temporada.[4]​ Como legalmente no está permitido que un club ceda a otro su plaza, a efectos legales el club que iba a jugar en Tercera división la temporada 2003-04 seguiría siendo el Alavés C, pero jugando en el campo del San Ignacio, apoyándose en la estructura del San Ignacio e incluso uniformándose con los colores del San Ignacio.Al no ser un club propiamente dicho, sino un equipo filial del Alavés, el Alavés C podría resucitar si los rectores del club deciden en algún momento que sería interesante tener ese equipo para la formación de jugadores.Nota: Las temporadas indicadas con * se refieren a las que jugó como Alavés C-San Ignacio.