La junta de fortificaciones dirigida por William H. Taft recomendó que los puertos clave de los territorios adquiridos después de la Guerra Hispano-Estadounidense fueran fortificadas, concretamente las siguientes islas: El Fraile, Carabao, Corregidor, Grande y Caballo.
En ese momento estaban asignadas a las defensas del puerto alrededor de 4 967 soldados.
Las unidades de defensa del puerto fueron fuertemente comprometidas durante la invasión japonesa de 1941-1942, particularmente las baterías Way y Geary en Corregidor, así como Fort Drum.
El comandante de artillería costera, el mayor general Joseph A. Green, recomendó reasignar elementos de la defensa del puerto a defensa antiaérea, pero la propuesta fue rechazada.
Con la excepción de las áreas cubiertas por el 60.º y el 200.º regimiento de artillería costera (antiaérea), las islas filipinas eran virtualmente indefensas contra un ataque aéreo.