Después de ser movilizado para luchar en la Segunda Guerra Mundial en 1939 y posteriormente alistado en las filas de Francia Libre, empezó a dirigir la Delegación Arqueológica Francesa en Afganistán (DAFA).

Un año más tarde, trabajó junto a Paul Perdrizet y Henri Seyrig.

En 1967 sustituyó a Henri Seyrig como director del Instituto Francés de Beirut.

Schlumberger falleció el 20 de octubre en Estados Unidos, cuando realizaba unos estudios en Princeton.

Sus obras escritas se incluyen a título póstumo en la publicación The Cambridge History of Iran (1983).