A los 13 años, entró como novicio en el Monte Hiei, centro de la Escuela Budista del Tiantai.

Todos estos conceptos, sin embargo, están íntimamente interrelacionados unos con otros en el grado en el que todos están directamente conectados con zazen, o la meditación sentada, la cual consideraba Dōgen que es idéntica al Zen, como se expresa claramente en la primera frase del manual de enseñanza de 1243 "Zazen-gi" (坐禪儀; "Principios de Zazen"): Cuando hace referencia a zazen, Dōgen a menudo se refiere específicamente a shikantaza, traducible libremente como "nada más que sentarse" o "sólo sentarse", que es un tipo de meditación sentada en la cual: Dōgen subrayaba a menudo la importancia crítica de zazen, o meditación sentada como práctica central del budismo.

[5]​ En su Fukan Zazengi, Dōgen escribió: Dōgen llamaba a esta práctica de zazen "sin pensar" (hi-shiryo) en la que uno es simplemente consciente de las cosas tal como son, más allá del pensar y del no-pensar -el esfuerzo activo por no pensar-.

[8]​ El término shō (證, verificación, afirmación, confirmación, logro) también se traduce a veces como "iluminación", aunque esta traducción también es cuestionada por algunos estudiosos.

Debes darte cuenta de que cuando el pensamiento correcto está presente, la torpeza y la agitación no pueden entrometerse.

Rechazó cualquier punto de vista que considerara la naturaleza búdica como un ser interior permanente y sustancial o un fundamento.

[17]​ Así pues, se habla de los dos términos a la vez para subrayar que las cosas no deben verse como conceptos separados.

Además, se trata de no abstraer el tiempo y el ser como conceptos racionales.

[24]​ Como señala Döll, "es este segundo tipo, como sostiene Müller, el que permite una visión positiva del lenguaje incluso desde la perspectiva radicalmente escéptica de la marca del budismo zen de Dōgen.

"[22]​ Dōgen criticaba a veces a la escuela Rinzai por su práctica formulaica e intelectual del koan (como la práctica del Shiryoken o "Cuatro Discernimientos")[25]​ así como por su desprecio hacia los sutras: Recientemente en la gran dinastía Sung de China hay muchos que se hacen llamar "maestros zen".

Si el Dharma del Buda pudiera condensarse en dos o tres dichos de Lin Chi y Yun Men, no se habría transmitido hasta nuestros días.

Difícilmente se puede decir que Lin Chi y Yun Men sean los Venerables del Buda-Dharma.[25]​.