Fue hasta 2001 donde el equipo logró otro ascenso, esta vez a la Primera Categoría cantonal y posteriormente alcanzó el bicampeonato del cantón Cayambe en 2005 y 2006, llegando a la Segunda Categoría del fútbol profesional de Ecuador tras ganar la Copa Pichincha.

[6]​ La buena racha continuaría durante tres temporadas seguidas, 2010, 2011 y 2012;[7]​ en dichos años el club logró el subtítulo provincial tras el tricampeonato de Sociedad Deportiva Aucas,[8]​[9]​ se destacaron varios jugadores importantes, uno de ellos José Quintero, llegando a jugar en Liga y ser seleccionado nacional.

En 2011 llegó hasta el hexagonal final donde terminó segundo detrás de Mushuc Runa, también fueron parte del grupo Águilas, Alianza del Pailón, Club Social y Deportivo Macas y Fuerza Amarilla.

[15]​[16]​ Lo posterior fueron temporadas regulares desde el torneo provincial 2013 hasta 2020,[17]​ donde se destaca el tercer puesto en los campeonatos de 2017[18]​[19]​ y 2019; en 2014 el club logró salvarse del descenso al terminar en el noveno lugar.

Para 2022 regresaron al fútbol de Segunda Categoría con un nuevo proyecto liderado por inversión extranjera.