El Monagas Sport Club fue fundado el 23 de septiembre de 1987 por Joaquín Fariñas, Ramón Ramírez, Enrique Polo, Rubén León, Francisco "Paco" Espinoza y Luis Enrique Rodríguez, iniciando su participación en la Segunda División en el año 1988.

Esa misma temporada el delantero Alexander "Comanche" Bottini lograría ser el máximo goleador del torneo con 15 goles.

En la temporada 1994/95 realizó su mejor participación en esta primera etapa en Primera División al conseguir avanzar a la segunda fase del torneo y quedar eliminado al ocupar la cuarta posición del grupo B solo a 0.50 puntos del tercer lugar que ocupó el UA Táchira que daba el último cupo a la fase final del torneo, lo que lo llevó a ocupar la posición 8 en la tabla acumulada de esa temporada en la que participaron 23 equipos.

El Monagas Sport Club clasificó a la Copa Sudamericana en la temporada 2001/02 tras culminar en la 2.ª posición en la tabla acumulada con 64 puntos.

En el 2002 el Monagas Sport Club le ganó al Deportivo Táchira en los dos partidos que jugaron en la primera ronda: (0-2) en San Cristóbal; (3-0) en Maturín.

En la temporada 2002/03 clasifica nuevamente a Copa Sudamericana tras culminar en el cuarto puesto en la tabla acumulada con 45 ptos.

Desde su fundación ya son varios los jugadores que han podido debutar con el primer equipo en Primera División.

El Monagas Sport Club luego de 9 años logró clasificar a su tercera participación en una copa internacional.

Finalizó el Torneo Clausura 2013 sumando apenas 12 puntos y se ubicó en la posición 16 de la clasificación; sin embargo, en la tabla acumulada quedó relegado a la posición 18 con apenas 27 puntos, situación que lo condenó a la Segunda División.

[11]​ Para el 2016, comienza a jugar el Torneo Apertura 2016 de la Primera División del Fútbol Venezolano.

[12]​ En marzo del mismo año luego de disputar la Jornada 7, el director técnico Edwin Quilagury, manifiesta su retiro del equipo, por los problemas económicos y de logística, quedando encargado temporalmente el Asistente Técnico, Miguel Perdomo para la Jornada 8, dejando al equipo en la posición 17 con 2 victorias, 1 empate y 5 derrotas.

[14]​ Se realizaron contrataciones de jugadores con larga experiencia en Primera División como Luis Cariaco González, Armando Maita y Ángel Hernández, entre otros.

Esto debido a que la ciudad cumplía con las condiciones establecidas por CONMEBOL para albergar el torneo.

Su mejor resultado en este torneo fue en el año 2019 donde logró llegar a la Final y enfrentarse por el Título ante el Zamora FC.

Jugadores del Monagas Sport Club que han logrado ser máximos goleadores en una temporada en la Primera División de Venezuela.

El Monagas Sport Club en su paso por la Primera y Segunda División ha contado con más de 20 entrenadores diferentes.

Y en su primera temporada lograron llegar hasta la fase de grupos del Torneo Apertura 2017