Ctenomys emilianus

[3]​ Los descriptores originales de esta especie fueron Thomas y St.

Lager, con una publicación en la revista Annals and Magazine of Natural History, volumen 9, número 18 (página 637) en 1926.

[3]​ Además aún no está confirmada su presencia en el parque nacional Laguna Blanca[7]​ y en la reserva provincial Auca Mahuida.

[10]​ A nivel mundial está considerado como en preocupación menor ya que no se reportan amenazas inminentes.

Sin embargo se considera que su población está decreciendo, además de ser una especie rara y encontrarse en pocas localidades.