La 96.ª Copa del Emperador (第96回天皇杯全日本サッカー選手権大会, Dai 96-kai Tennōhai Zennihon Sakkā Senshuken Taikai?)

[1]​ El campeón fue Kashima Antlers, tras vencer en la final a Kawasaki Frontale.

Los restantes equipos iniciaron su campaña en la primera ronda.

Todos los 18 equipos pertenecientes a la J1 League 2016.

Todos los 22 equipos pertenecientes a la J2 League 2016.