Luego se completaron los emparejamientos con los equipos del primer bolillero, que fueron locales en el partido de vuelta.

En esta etapa participaron los 22 equipos clasificados en la Primera fase y los 10 transferidos de la Copa Libertadores 2018.

Pérez Torres Giraldo Caicedo Sand Guerrero Rodríguez Orejuela Cruz

Rodrigo Lindoso Aguirre Marcinho Kieza Renatinho Moisés Gilberto Zé Rafael Jackson Allione Nilton Flávio

Jonathan Raphael Veiga González Pablo Vinícius Zé Rafael Edigar Junio

Reporte Jonathan Veiga Bérgson Renan Lodi Thiago Heleno Narváez Fuentes Pérez T. Gutiérrez Viera