La Copa Intertoto de la UEFA 1996 es la 2.º edición de este torneo de fútbol a nivel de clubes organizado por la UEFA, en donde participaron 60 equipos del continente.

El torneo dio 3 plazas para la Copa de la UEFA 1996-97, las cuales se ganaron el Silkeborg IF de Dinamarca, el Guingamp de Francia y el Karlsruher de Alemania.

Los 60 equipos fueron distribuidos en 12 grupos de 5 equipos, los cuales se enrentaron a una vuelta todos contra todos, pero a diferencia de la edición pasada, solamente el vencedor de cada grupo avanzó a la siguiente ronda.

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