Luego se completaron los emparejamientos con los equipos del primer bolillero, que fueron locales en el partido de vuelta.
En esta etapa participaron los 22 equipos clasificados en la Primera fase y los 10 transferidos de la Copa Libertadores 2018.
Cadavid Domínguez Hauche Quiñones Morelo Guastavino Salazar Gordillo Zapata
Rodrigo Lindoso Aguirre Marcinho Kieza Renatinho Moisés Gilberto Zé Rafael Jackson Allione Nilton Flávio
Jonathan Raphael Veiga González Pablo Vinícius Zé Rafael Edigar Junio
Reporte Jonathan Veiga Bérgson Renan Lodi Thiago Heleno Narváez Fuentes Pérez T. Gutiérrez Viera