[1]​[2]​ Funciona desde 1985, es reconocida a nivel nacional e internacional como articulación que trabaja para poner en la agenda pública la problemática y propuestas de solución en materia de derechos humanos.

El Comité Ejecutivo de la CNDDHH decidió formalizar la institución en 1991.

[3]​ Durante 1993, en la gestión de Rosa María Mujica Barreda se realizó la revisión de los integrantes del directorio y se reinscribió formalmente a las organizaciones parte.

[3]​ Durante los primeros años de su creación, la CNDDHH realizaba Encuentros Bienales que se institucionalizaron en Grupos de Trabajo.

[4]​ La CNDDHH cuenta con estatus consultivo especial ante el Consejo Económico y Social de las Naciones Unidas (ONU), y está acreditada para participar en las actividades de la Organización de Estados Americanos (OEA).