Está regido por un estatuto que es ejecutado por el Presidente del Consejo, Vicepresidentes, un Tesorero, un Secretario y Consejeros.

Las primeras se realizan por lo menos en forma anual, en ellas se trata cualquier asunto que no sea la modificación de Estatutos ni la disolución del Consejo Nacional Agropecuario.

Es la instancia encargada de dirigir al Consejo Nacional Agropecuario, constituida por el Presidente del Consejo, quien será a su vez el Presidente del Comité Directivo, por Vicepresidentes, un Tesorero, un Secretario y Consejeros.

Las Comisiones tienen como objetivo actuar como instancias para generar gestiones, consultas, proyectos e iniciativas; definir acciones o posicionamientos institucionales y recomendaciones, para promoverlas y darles seguimiento ante el Poder Ejecutivo, Poder Legislativo u otras instancias.

El objetivo del Foro es analizar los temas más importantes para el sector agroalimentario, con las cuales, se puedan generar herramientas para la toma de decisión a los agentes de las organizaciones correspondientes en México.