El condado de San Juan (en inglés: San Juan County), fundado en 1876, es uno de los 64 condados del estado estadounidense de Colorado.

[1]​ Según la Oficina del Censo, el condado tiene un área total de 1006 km² (388,4 mi²), de la cual 1003 km² (387,3 mi²) es tierra y 2 km² (0,8 mi²) (0.22%) es agua.

En el 2000[2]​ la renta per cápita promedia del condado era de $30 764, y el ingreso promedio para una familia era de $40 000.

En 2000 los hombres tenían un ingreso per cápita de $30 588 versus $19 545 para las mujeres.

El ingreso per cápita para el condado era de $17 584.