[1] Previo a su realización, el intestino grueso (colon) es preparado de tal forma que no queden residuos sólidos (mediante laxantes o catárticos).No es una anestesia general, dado que el paciente despierta rápidamente en cuanto sea requerido y además respira por sus propios medios.El colon debe estar libre de sólidos para que la prueba se realice correctamente.Las bebidas deportivas contienen electrolitos que se consumen durante la limpieza intestinal.[5][6] El procedimiento puede incluir un laxante en comprimidos o un preparado para el lavado intestinal con polietilenglicol en polvo disuelto en cualquier líquido claro, como una bebida deportiva que contenga electrolitos.
