El presidente de CpM desde su fundación es Mustafa Aberchán y su portavoz parlamentario es Hassan Mohatar.

Con Mustafa Aberchan como líder y cabeza de lista, se presentó a las elecciones autonómicas de 1995 (las primeras tras la conversión de Ceuta y Melilla en ciudades autónomas) quedando en tercer lugar, con cinco diputados (tras el Partido Popular, con catorce, y el PSOE, con cinco, el cual, sin embargo, sufrió una caída espectacular en votos respecto a las anteriores elecciones municipales, en las que obtuvo once concejales).

Dicha formación, en compañía del PSOE, la Unión del Pueblo Melillense y Coalición por Melilla, planteó una moción de censura, la cual, aunque impedida ilegalmente[cita requerida] por el alcalde-presidente, Ignacio Velázquez, fue finalmente tramitada en agosto de 1998, llevando a Palacios al poder.

Los cuatro partidos pactaron la moción y decidieron dar sus votos al entonces Líder de la Unión del pueblo Melillense, Juan José Imbroda (PP).

Finalmente con 6.514 votos no pudo entrar con ningún representante ni en el Congreso, ni en el Senado y quedó como segunda fuerza en Melilla por detrás de la coalición formada por la Unión del Pueblo Melillense y el PP.

En el año 2005 Salima Abdeslam se convirtió en la primera diputada parlamentaria en España en llevar el hiyab.

Así, CpM mantenía su soberanía en Melilla y participaba en el Consejo Político Federal de IU.