El Club Universidad Nacional Premier fue un equipo filial, sin derecho a ascenso, del Club Universidad Nacional de la Primera División de México.

El 25 de mayo de 2015 se anunció que los 18 equipos de Primera División tendrían un equipo filial en la Liga Premier de la Segunda División, para que los jugadores que superen los 20 años de edad y ya no puedan participar en la categoría Sub-20 se mantengan activos.

[1]​ Así, Pumas fundó la filial de Segunda División llamándola "Club Universidad Nacional Premier", utilizando como base al Pumas Naucalpan que participaba en la Liga de Nuevos Talentos.

[2]​ En la temporada 2018-19, el equipo gana su segundo campeonato al conquistar la Liguilla de Filiales 2018-19, derrotando nuevamente a Chivas.

[4]​ En 2020 la directiva del Club Universidad Nacional, un grupo de empresarios y el gobierno de Tabasco crearon el equipo Pumas Tabasco para su participación en la Liga de Expansión MX, esta escuadra se formó originalmente con los jugadores del equipo Premier de los Pumas, por lo que este equipo fue descontinuado y dejó de jugar en la Liga Premier de la Segunda División.