Sport Coopsol Trujillo

La siguiente temporada, una buena campaña le otorgó el título de campeón en la segunda división trujillana.Para el año siguiente conformó un buen equipo y logró el título de la Copa Perú tras dejar en el camino a Sport Áncash en la etapa regional,[3]​ a Deportivo Pomalca y Estudiantes de Medicina en la nacional y al Alfonso Ugarte, al que logró derrotar en la final mediante un partido extra jugado en Lima, el cual ganó 3-2.Luego de su participación en el Campeonato Descentralizado 2000, el siguiente año -debido a problemas económicos- el Grupo Empresarial Coopsol adquirió el club,[5]​ independizándose de la universidad por completo y cambiando el nombre a Sport Coopsol Trujillo.Aquel año se mantuvo en la zona baja de la tabla, ubicándose noveno entre doce participantes.Con el objetivo de revivir al equipo histórico que militó en la primera profesional, empezando desde las bases y canteras.