[13][14] Además de los 49 campeonatos uruguayos,[15][16] es el club que ha ganado más títulos organizados por la AUF al tener en cuenta otros torneos.A través de dicha copa se clasificó para disputar la hoy discontinuada Copa Intercontinental, coronándose campeón en todas las veces que la disputó, convirtiéndose en el primer tricampeón invicto de dicha competencia en 1988 y el primero en ganar este torneo desde que se empezó a disputar en Japón en 1980[25][26][27] siendo también el club más laureado de dicha competencia junto con Boca Juniors, Real Madrid, Milan y con su máximo rival, Peñarol.[43][44] Los partidos entre Nacional y Peñarol se encuentran entre los tres clásicos más atractivos del mundo, de acuerdo con la revista británica FourFourTwo.Nacional formó con Alejandro Cordero, Arturo Corradi, Jorge Ballestero, Félix N. Rosati, Carlos Carve Urioste, Bernardino Daglio, Jaime Gianetto, Sebastián Puppo, Domingo Prat, Juan Vallarino y Melitón Romero.El 10 de agosto, en el partido clave por la definición del campeonato, venció nuevamente al CURCC por 3:1 en Villa Peñarol, adjudicándose su primer título.[47] A inicios del siglo XX las selecciones uruguaya y argentina se enfrentaban en un partido anual, con localía intercalada.Molesto por esta situación, el CURCC renunció a formar parte del combinado, por lo que Nacional asumió con todos sus futbolistas la representación de la selección uruguaya.Parecía que el partido sería fácil para el seleccionado argentino, el cual el año anterior había goleado de visitante —0:6 en el Parque Central—.[58] En 1932 el fútbol uruguayo se tornó profesional, y ya en 1933 Nacional formó un gran equipo que fue conocido como «La Máquina Blanca».[n 2] Para obtener el título de 1941, el club ganó todos los partidos disputados, incluyendo una victoria 6:0 frente a Peñarol.Al año siguiente, Zezé Moreira sustituyó a Hugo Bagnulo como entrenador, implementó la táctica brasileña 4-2-4 y obtuvo el Uruguayo de 1963.[66] Con Miguel Restuccia como presidente, Nacional comenzó a armar un equipo que con el tiempo daría sus frutos: están Luis Ubiña, Juan Martín Mugica, Julio Montero Castillo, Víctor Espárrago y Julio César Morales a los cuales se sumaron el guardameta brasileño Manga y el juvenil Atilio Ancheta.[25] El año siguiente, ganó su primera Copa Interamericana, derrotando al Cruz Azul mexicano, siendo el único club uruguayo en contar con este trofeo en su palmarés.[70][71][72] Con este triunfo, Nacional se consagró como el primer tricampeón mundial invicto, gesta igualada años después por el São Paulo FC de Brasil.[83] El presidente Ricardo Alarcón decidió contratar como nuevo entrenador a Juan Ramón Carrasco,[84] tras el corto período de Luis González.Tras la salida de Gutiérrez, contratado por el Al-Shabab, Nacional pasó a ser dirigido por Gustavo Munúa, que hasta entonces se desempeñaba como arquero y capitán.Aunque bajo su dirección el equipo obtuvo la Supercopa 2019 ante Peñarol y en el plano internacional consiguió dos victorias por la Copa Libertadores 2019, por el Torneo Apertura quedó relegado rápidamente con solo tres puntos tras las primeras cinco fechas.[104] La primera camiseta, utilizada desde la fundación del club en 1899 hasta el año 1902, fue de color rojo, con el cuello y la manga azules.[136][137] Recientemente se construyeron 700 metros de muro en hormigón, lo que permite el cercado perimetral del complejo mejorando ampliamente la seguridad y privacidad.Lo próximo a realizar para culminar la etapa 1 denominada "Misión Walter Ferreira" es un nuevo vestuario, utilería, concentración y sanidad.El utilero de comienzos del siglo XX, Prudencio Miguel Reyes, era famoso por su continuo aliento al equipo tricolor.[193] La bandera más grande del mundo se volvió a desplegar en el encuentro disputado entre Nacional y Atlético de Madrid por la Copa EuroAmericana.En el año 2009, fue realizada durante un período de tres semanas una encuesta en la página web sportsvs.com,[218] la cual dio como ganador a Nacional por escaso margen.Desde su fundación en 1899, han sido centenares los futbolistas en disputar al menos un encuentro con la camiseta del primer equipo de Nacional.[255] En la era Tabárez que obtuvo el cuarto puesto en la Copa Mundial de 2010 y el primer puesto en la Copa América 2011, Uruguay contó con numerosos exjugadores de Nacional, entre ellos Diego Lugano, Diego Godín, Andrés Scotti, Mauricio Victorino, Sebastián Eguren, Nicolás Lodeiro, Luis Suárez y Sebastián Coates.[259] Cabe destacar la presidencia del socio fundador argentino Bernardino Daglio, en el año 1901, como el primer extranjero en el máximo cargo de la institución.Obtuvo varias veces las competiciones más importantes: la Vuelta Ciclista del Uruguay[283] y Rutas de América, tanto a nivel individual como por equipos.Obtuvo el Campeonato Uruguayo en 1997, 2000, 2010, 2011-2012, 2020 y 2022, siendo el segundo equipo que más veces se coronó campeón, detrás de Rampla Juniors (9 conquistas).Luego se enfrentó por la final con Carlos Barbosa, campeón de la Zona Norte, con el que cayó derrotado 8:2 y 5:1 en Brasil.En ese recinto se disputan los partidos del club en los campeonatos organizados por la Federación Uruguaya de Voleibol en todas sus categorías: menores, juveniles y mayores.
Carta de la Asociación Uruguaya de Fútbol a Nacional en la cual lo reconoce como el club más antiguo de la asociación en julio de 1924, cuando Peñarol estaba desafiliado de la misma.