Recibió su consagración episcopal el 25 de mayo siguiente del arzobispo Aloísio Lorscheider, OFM, con los obispos Mauro Morelli y Urbano Allgayer como co-consagradores.
Fue aquí donde comenzó su apoyo a la muy criticada teología de la liberación, y forjó su amistad con el jefe del sindicato en ese momento, Lula.
Más tarde predicó los ejercicios espirituales cuaresmales para Juan Pablo II y la Curia romana en 2002.
Uno de los cardenales electores que participaron en el cónclave papal de 2005 que seleccionó al papa Benedicto XVI, el cardenal Hummes fue mencionado a menudo como un posible sucesor del papa Juan Pablo II.
En 2013 sirvió como uno de los 115 cardenales en el cónclave que eligió al papa Francisco.
Debido a la precedencia, durante el juramento, tomó el juramento de secreto de los cardenales justo antes del cardenal Jorge Mario Bergoglio, quien finalmente sería elegido papa.
Una Iglesia con una 'cara amazónica' y un 'clero nativo', como lo propuso el papa Francisco en su discurso a los obispos de Brasil".
"Este es un momento muy importante y muy emotivo, el papa quería participar simbólicamente, como todos nosotros, que hemos puesto nuestros zapatos, queremos participar simbólicamente en la marcha mundial por el cambio climático aquí en París".
Había muchas expectativas, era una gran y simbólicamente fuerte forma de presión de la gente, y también la presencia del papa Francisco, en este clamor para evitar el cambio climático".
Criticó la propagación del capitalismo global, afirmando que la privatización de las empresas estatales y la reducción de los aranceles han contribuido a "la miseria y la pobreza que afectan a millones en todo el mundo".
Publicó una declaración oficial condenando los ataques anónimos contra personas indígenas sin hogar.
Fue amigo del papa Francisco y fue definido por el papa como "un grande" en una entrevista que concediera a la corresponsal de Noticieros Televisa, Valentina Alazraki, en marzo de 2015.
Y así, el nombre ha entrado en mi corazón: Francisco de Asís”.