Limita al norte con el municipio de El Barrio de la Soledad, al este y sur con el municipio de Asunción Ixtaltepec, al suroeste con el municipio de Magdalena Tlacotepec y al oeste con el municipio de Santo Domingo Chihuitán.
En el municipio de Ciudad Ixtepec se localizan 23 localidades, las principales y su población en 2010 se enlistan a continuación: El gobierno de Ciudad Ixtepec corresponde al ayuntamiento, éste es electo por el principio de partidos políticos, vigente en 146 municipios de Oaxaca,[4] a diferencia del sistema de usos y costumbres vigente en los restantes 424, por tanto su elección es como en todos los municipios mexicanos, por sufragio directo, universal y secreto para un periodo de tres años no renovables para el periodo inmediato pero si de forma no consecutiva, el periodo constitucional comienza el día 1 de enero del año siguiente a su elección.
[5] El Ayuntamiento se integra por el presidente municipal, dos Síndicos y un cabildo formado por ocho regidores.
El municipio de divide en cuatro agencias municipales.
Para la elección de diputados locales al Congreso de Oaxaca y de diputados federales a la Cámara de Diputados federal, Ciudad Ixtepec se encuentra integrado en los siguientes distritos electorales: Local: Federal: