Inventó el pantógrafo, dispositivo con el cual es posible dibujar un objeto a escala.Al principio colocó lentes coloreadas, pero después usó la técnica de proyección.En marzo de 1611 descubrió las manchas solares, un fenómeno que contrariaba la idea de la perfección del Sol y, por este motivo, evitó darlo a conocer.Galileo Galilei emprendió una disputa con Scheiner sobre quién había descubierto primero las manchas solares; lo que parece ser es que no fue ninguno de los dos, sino David Fabricius.Scheiner continuó con el estudio del Sol otros dieciséis años antes de que saliera a luz su trabajo más importante, titulado Rosa ursina.