El río fluye en dirección sureste y entra en el óblast de Vólogda, donde recibe el Goryun por la izquierda.
En la provincia de Vólogda, el Chagodoshcha gira hacia el este y recibe el Lid por la izquierda y, justo aguas arriba del asentamiento de Chagoda, el Pes por la derecha.
A continuación, gira hacia el sureste y entra en el distrito de Ustyuzhensky.
La desembocadura del Chagodoshcha se encuentra en el asentamiento de Imeni Zhelyabova.
Actualmente no se utiliza para ninguna navegación comercial.