Comenzó su carrera a los siete años y ha sido galardonado tres veces con el Young Artist Award y el GLAAD Media Award.
[6] Se crio en un hogar católico romano «estricto» y se considera a sí mismo una «persona profundamente espiritual» debido a su educación.
[8][9] Allen actuó como estrella invitada en varias series de máxima audiencia, incluido un primer episodio de Airwolf por el que fue nominado como «Mejor Actor Joven: Elsewhere, en la que interpretó al niño autista Tommy Westphall (1983-88).
Elsewhere, Allen formó equipo con su hermana Charity Allen en un episodio del programa de juegos infantiles de los sábados por la mañana I'm Telling!
[16] A partir de Third Man Out (2005), Allen interpreta a Donald Strachey, un detective privado gay con una relación monógama, en una serie de telefilmes para la cadena Here!
[17] Cuando Allen interpretó al misionero cristiano de la vida real Nate Saint en el docudrama End of the Spear (2006), algunos cristianos conservadores arremetieron contra los productores por dar el papel a un hombre abiertamente gay.
Entre junio y agosto de 2008, Allen actuó junto a Valerie Harper en Looped, una obra basada en una sesión vespertina de looping con Tallulah Bankhead para la película ¡Muere!