[1][2] Su cima se eleva a una altitud de 1471,92 m s. n. m. (4 829 pies) y a sus pies, a 1187 m s. n. m. (3 894 pies), se emplaza la ciudad de Salta, capital de la provincia.
Respecto a la ciudad, el cerro tiene una altura de 284.92 m, según indica el mojón ubicado en la cima del mismo.
Esta limita a la ciudad por el este y constituyen el borde nor-oriental del valle de Lerma, cordón montañoso cubierto de abundante vegetación selvática denominada Yungas.
Hace millones de años, el cerro San Bernardo estuvo sumergido bajo el mar.
En las rocas de las laderas es posible encontrar fósiles marinos, tales como los trilobites.